Музей расположен на территории культурного комплекса «Кремль в Измайлово» в уникальном месте - на берегу Серебряно-Виноградного пруда, где юный царевич Пётр осваивал азы морского дела, самостоятельно управлял своим первым кораблем - Ботиком.

Музей истории основания Российского флота был открыт в 2009 году. Перед глазами ребят открылся мир приключений и исторических подвигов. Ребятам очень понравилась экскурсионная программа музея, которая включает в себя рассказ о создании Российского военно-морского флота, историю судостроения от египетских парусников к европейским корветам.

Здесь можно ознакомиться с основными этапами научно-исследовательской работы русских моряков и историей Второй мировой войны. Особое место в экспозиции отведено подвигу крейсера «Варяг». Отдельный зал Музея оформлен деталями интерьера барка «Крузенштерн», где проходила встреча Владимира Владимировича Путина и Уго Чавеса.